EC-CUBEを解凍すると初期ディレクトリは以下のようにdataディレクトリとhtmlディレクトリが同じ階層に並んでいますよね。
このままhtml以下をサイトのドキュメントルートにすればよいのですが、たまにドキュメントルート以下にdataフォルダが置かれていることがあります。
Webサーバーの設定などで.txtや.logは見れなくしている場合もありますが、へたをするとログファイルや通常見せたくないファイルまで見せてしまうのでdataフォルダーはドキュメントルートより上に配置しましょう。
追伸:最新バージョン(2.13.3)ではdataフォルダー以下へのアクセスを.htaccessファイルで制御しているので問題は無さそう。不安ならドキュメントルートより上に置くことももちろんできます。
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